Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms