Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms