Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms