Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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