Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms