Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms