Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRBP1Q9P2E9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms