Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms