Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms