Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms