Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms