Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms