Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms