Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFJQ9BTM1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms