Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDHD3Q9BSH5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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