Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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