Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms