Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms