Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms