Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GFI1Q99684 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms