Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms