Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF607Q96SK3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF607Q96SK3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms