Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms