Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms