Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms