Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRUQ92729 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms