Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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COPS9Q8WXC6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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COPS9Q8WXC6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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COPS9Q8WXC6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
COPS9Q8WXC6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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