Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms