Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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FAT3Q8TDW7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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FAT3Q8TDW7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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