Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms