Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1455.8 ms