Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN19Q8N6F1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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