Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PROM2Q8N271 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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