Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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