Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms