Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC149Q6ZUS6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms