Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC141Q6ZP82 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms