Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD13Q5VXD3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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