Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD4Q5VX71 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms