Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF8Q5VWM4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms