Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms