Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms