Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDSS1Q5T2R2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms