Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms