Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGD3Q5JSP0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms