Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms