Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL9Q3SXZ7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms