Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms