Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC57Q2TAC2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms