Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL24A1Q17RW2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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COL24A1Q17RW2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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COL24A1Q17RW2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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COL24A1Q17RW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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